Aurajokisäätiön toiminnan tavoitteena on ekologisesti terve sekä maisemallisesti ja virkistyksellisesti arvokas Aurajoki. Säätiö tukee ja edistää veden laadun parantamiseen tähtääviä toimia, Aurajoen kulttuurimaiseman suojelua ja hoitoa, jokeen liittyvää tutkimustoimintaa, joen kala- ja raputaloutta sekä virkistyskäyttöä.
